skbio.alignment.TabularMSA.to_dict

TabularMSA.to_dict()

创建一个 dict 由此 TabularMSA .

状态：从0.4.1开始试验。

返回:

由索引标签和序列构造的字典 TabularMSA .

返回类型:

dict

抛出:

ValueError -- 如果索引标签不是唯一的。

参见

from_dict, index, reassign_index

示例

>>> from skbio import DNA, TabularMSA
>>> seqs = [DNA('ACGT'), DNA('A--T')]
>>> msa = TabularMSA(seqs, index=['a', 'b'])
>>> dictionary = msa.to_dict()
>>> dictionary == {'a': DNA('ACGT'), 'b': DNA('A--T')}
True