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根据来源，GIS数据分为原始数据与间接数据。 原始数据（primary data）是研究人员通过实验和调査直接采集、获取的数据。 间接数据（secondary data）是指官方或其他个人、组织提供的数据。 官方数据来自政府权威机构。 非官方数据来自个人或民间团体、研究机构、市场调查、民意测验或网络数据。 通常环境研究中，应当明白何时可以使用间接数据，何时应避免使用间接数据。 也可以采用原始数据与间接数据混合使用方式， 如火灾过后植被的恢复、土壤中污染物对作物生长的影响、污染物对儿童成长影响等诸多项目研究。 数据采集与使用过程中，原始数据与间接数据具有同样作用。
间接数据不仅为原始数据提供环境背景， 也从一致性和数据质量为原始数据提供验证和确认； 间接数据可以作为原始数据的替代，特别是因为时间、成本等理由， 使数据采集是一次性的或不需要重复采集，如人口数据采集。
间接数据的优势是:①间接数据便宜，采集时间短，采集方便。 ②以更方便的方式，利用已有数据。 ③间接数据的采集，使我们有机会访问那些难以接近的组织、个人或地域，增加工作交流机会。 ④间接数据使研究人员延长了研究的时间链， 利于现实环境与历史环境比较，预测环境趋势。 ⑤间接数据也用于避免或消除耗费时间的直接分析步骤。
利用间接数据也有缺陷，用户常不了解间接数据的采集方法和数据处理方式， 更没有机会接触到原始数据，被迫相信或承认数据原来采集人员的技能和品格， 也不得不接受间接数据分析方法是正确的，因此分析结果的可靠性有时值得怀疑。