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格式转换分为二大类：不同数据介质之间的转换， 即它是将各种不同的源材料信息如地图、照片、 各种文字及表格转换为计算机兼容的格式； 第二类是数据结构间的转换。 而数据结构间的转换又包括同一数据结构不同 组织形式间的转换和不同数据结构间的转换。
对于栅格结构，如果栅格GIS数据库要记录高程、 降水和土地利用类型三种信息，其数据的组织形式可以是不同的。 第一种组织形式可以是每一层次记录二种数据集， 即每一个文件记录包含不同的要素变量， 每一个文件中的每一栅格单元记录一个数字； 第二种组织形式可以是每一个单元内顺序记录不同的要素； 第三种组织形式可以是以行的形式按顺序记录各要素的数据。 当同时要使用二种及二种以上组织形式的数据时， 便要将其转换为对当前工作适用的统一的格式。
对于矢量结构，也有弧、节点组织形式、 全多边形组织形式等之间的转换。