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两类系统服务对象不同，各自形成相对独立的信息产业或产业群， 因此有它们各自的特性：
第一，数据库中的主要数据侧重面各异， 可以说FMIS以非空间数据为主要存储和处理对象， 空间数据为辅助对象，GIS则以空间数据为主要对象， 非空间数据为辅助对象。
第二，服务对象方面FMIS产生的信息既为 各级决策机构服务又为广大民众服务， 民众直接应用或操作频率很高，而GIS产生的信息， 在目前情况下，主要服务于决策机构， 广大民众接受的服务较少，直接运用和操作GIS的频率较低。
第三，对网络的要求不同。FMIS面向广大民众， 网络性能和覆盖面要求高，尤其是网络祺盖面， 几乎延伸到城市的各个部位，如ATM.POS联机网络系统， 分布密度越大，民众的金融活动越便利。 GIS目前还没有这种系统，即使建立， 其覆盖面也不必像FMIS要求的那么广泛。 但随着社会不断进步和信息时代的发展， 某些面向民众服务的GIS系统， 如气象、旅游、交通等服务性GIS走上街头， 民众可以在大型公共活动场所随意査询当地或异地动态信息， 网络覆盖面也会越来越大，GIS面向公众服务的程度也会不断增加。 第四，某些系统功能侧重点不同。 正因为两类系统数据侧重面的差异和某些功能不同，才形成了两类系统。