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湖泊水资源是湖区工农业生产、 人民生活和实现社会经济可持续发展不可或缺的重要物质基础。 我国湖泊总贮水量约为7077亿m3 ， 其中淡水贮量约为2249亿m3，占我国水资源总量的8%， 可见湖泊淡水资源的弥足珍贵。
我国湖泊淡水资源总量的4/5，即1794亿m3的贮水量分布于外流区。 这是因为外流区降水丰沛，径流丰富，水系发达， 是我国淡水湖泊的主要分布区，而且湖泊多是吞吐型， 为河流水系的组成部分。外流区中又以长江中下游地区湖泊的淡水资源最为丰富。 区内水网交织，湖荡星罗棋布，素有“水乡泽国”之称， 贮水量约750亿m3， 其中面积在100km2以上的湖泊就有29个， 面积为15812.6km2，贮水量约550亿m3。 仅鄱阳湖和洞庭湖等五大淡水湖多年年平均入湖径流量就达4800亿m3， 相当于淮河年径流量（260.3亿m3)的18.5倍， 长江年径流量的50%t本区湖泊换水周期短， 如洞庭湖仅18.2天、鄱阳湖20.9天、太湖也只有310.5天。 这说明人湖水量丰富，湖水更新速度快，湖水被利用后能在较短的时间内得到恢复。
云贵高原湖区亦属外流区，区内有大小湖泊60个， 面积约1199.4km2 。本区湖泊面积虽小， 但深度大，故淡水资源亦较丰富。全区湖泊都为淡水湖， 贮水量在291亿m3以上，其中抚仙湖为189亿m3。 但本区湖泊换水周期长，滇池和洱海分别为2.7年和3.0年， 抚仙湖达166.9年。湖水一经大量引用，将很难得到补充和恢复。
东北地区面积大于1.0km2 的淡水湖泊面积合计2115.4km2， 其中主要有兴凯湖、镜泊湖、月亮泡、连环泡和长白山天池等。 本区湖泊上游来水量较丰富，湖泊换水周期普遍较云贵高原湖泊短，如镜泊湖为174天。
蒙新高原和青藏高原湖区由于地处内陆，气候干旱， 降水稀少，以盐湖和咸水湖为主，淡水湖数量很少。 但这些湖泊多为冰雪融水补给，水量较丰，而且湖泊面积较大， 湖水较深，故淡水贮量相当可观。其中， 仅玛旁雍错、鄂陵湖、扎陵湖、嘻纳斯湖和贝尔湖等五湖的淡水贮量就达465亿m3以上， 远远超过云贵高原或东北地区湖泊淡水资源的总贮量。 但这些湖泊换水周期长，如喀纳斯湖长达2000天，湖水一旦被大量利用，恢复更新困难。