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FMIS和GIS具有许多共同的特性（利光秘1998）。
首先它们都是信息系统，共同拥有信息元素和系统元素， 信息系统的主要目标是收集信息、存储信息、 生产新信息和提供信息服务（胡志勇等2000）。
其次GIS也和FMIS—样含有管理元素。之所以称为GIS， 仅仅因为它的处理对象以地理信息为主。 地理信息是国民经济建设的重要信息，战略上看， 许多地理信息都属机密或绝密信息。例如，国防工程、 军事力量的空间布局信息， 战时军事活动的空间流动信息等属于地理信息， 都是保密程度很高的信息。这类信息需要管理元素的支持。 其他一些地理信息，例如土地变迁、土质变化、 物体空间过程演化、城市体系演化、城市内部结构演化、 环境质量变化等动态地理信息是有关可持续发展分析的重要依据， 空间位置信息更是各类信息定位的基础， 这些信息也都需要管理元素的支持。
第三，FMIS和GIS都是集信息学、计算机科学、 传播学（传播理论和通讯技术）、管理学、 逻辑学等学科为一体为某一学科服务的综合学科和综合技术。 还可以列出一些两者共同拥有的特征， 如FMIS也要以空间数据为基础进行信息分析和定位等。