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潮汐是河口特有的自然现象，也是河口区的本质属性。 珠江三角洲河口区属不规则混合半日潮，为弱潮河口，潮差较小， 平均潮差为0.85〜1.62m，最大潮差为2.9〜3.41m。 三角洲涨潮总量多年平均值为3500亿m3， 落潮总量多年平均值为6780亿m3，净泄量3280亿m3。 山潮比多年平均值以崖门最小为0.24,虎门次之为0.38,磨刀门最大为6.22。 虎门及崖门的山潮比均小于1，是受潮流作用为主的潮汐水道； 磨刀门山潮比大于6,是以径流作用为主的河道。
珠江三角洲受咸潮影响仅在近河口段，潮水最大含氯度的影响范围， 随上游径流量、下游潮流强度以及季节、所处空间位置等因素的不同而异， 据实测和调查资料分析，在八大口门中相对以虎门水道影响范围最为深广， 其次为鸡啼门、崖门、洪奇沥，影响最小的为磨刀门及横门。 随着上游来水量的减少，这种格局有一定的改变，位于磨刀门附近的珠海、澳门受咸潮影响越来越显著。
风暴潮是一种灾害性自然现象。是指由于风暴的强风作用引起港湾水面急速异常上升的现象， 根据其形成原因可以分为温带风暴潮和台风风暴潮。 珠江流域发生的风暴潮多为台风风暴潮，多见于夏秋时节，其特点是来势猛、速度快、强度大、破坏力强。
南方的风暴潮多发于汕头至珠江口一带、湛江地区以及海南岛东岸， 风暴潮危害性大，尤其是当其与天文髙潮相叠加时， 对我国珠江流域地方人民财产安全和经济建设构成了极大的威胁。 有关风暴潮的相关分析和研究表明，珠江流域风暴潮具有以下特征： ①风暴潮发生频繁而严重，均有前兆波、激增和余波3个阶段； ②由于特殊的水文和地形地貌特征，珠江口岸段是风暴潮最严重的岸段之一； ③华南地区风暴潮都是由华南台风造成的，向东开口的海湾最易形成特大风暴潮。